El Museu d'Història de la Ciutat és un museu viu, que s'obre a la ciutat, que es mou i que convida a la participació i dóna a conèixer el procés de formació de Girona, des de l'aparició de les primeres restes humanes a la zona fins a la transició a la democràcia i parlar de la societat que ha fet possible, en un recorregut cronològic que comprèn catorze sales que es completa amb diversos àmbits temàtics com el que està dedicat la Girona industrial. Ciutat pionera, la sala de la sardana i la cobla i l'espai contemporani.

Els seus continguts els trobem repartits entre l'edifici principal, situat al carrer de la Força i escampats per diferents indrets de la ciutat, que s'integren a la Xarxa d'Espais de memòria Democràtica com són el refugi antiaeri del Jardí de la Infància, la presó provincial i la fossa comuna que són una extensió de la sala dedicada a la Guerra Civil i també gestiona el taller de la Marfà, futur centre d'interpretació de patrimoni industrial de la ciutat.